拜仁女子足球队成立于1970年，建队初期球队的实力就非常强劲，并在1976年首次夺得了联赛冠军。不过之后的二十多年却急速下滑，在次级联赛征战多年之后拜仁女队终于在2000年重新回到顶级联赛。2015年，拜仁女队更是以赛季不败的成绩夺冠，这也是队史收获的第二个联赛冠军。六年之后拜仁女队凭借两分的优势成功超过沃尔夫斯堡成为冠军。

　　相较于女队，拜仁男队的历史更为悠久，他们收获的冠军次数自然也更多一些。拜仁男队俱乐部虽然在1900年就已经成立，但在1962年德国足球协会成立后明令规定同城市不能有两支队伍参加德甲。而在拜仁之前还有更早成立的慕尼黑1960，当时这支俱乐部成立于1860年。协会给出的理由是慕尼黑1860夺得了当年全国联赛的冠军，拜仁只是第三，因此拜仁没能成为联赛的创始俱乐部，错过了首个赛季拜仁只在两年后升入了德甲。

　　拜仁的第一个德甲冠军是在1968-1969赛季获得的，传奇教练布兰科·泽比奇率领仅仅十三名球员，但他们却斩获了球队和德国足球历史上第一个国内内联赛与杯赛的双冠王荣誉。在这之后拜仁虽然有过起起落落，但仍然在新世纪开始前夺得了十五次联赛冠军。21世纪拜仁的成绩稳中有升并在弗里克执教后取得了六冠王的成就，联赛也实现了九连霸。